Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clip2Q9Z0H8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms