Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms