Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ntn3Q9R1A3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms