Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nek3Q9R0A5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nek3Q9R0A5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nek3Q9R0A5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nek3Q9R0A5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nek3Q9R0A5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nek3Q9R0A5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nek3Q9R0A5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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