Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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