Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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