Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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