Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nectin3Q9JLB9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nectin3Q9JLB9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nectin3Q9JLB9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms