Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FancaQ9JL70 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms