Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gde1Q9JL56 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms