Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pole3Q9JKP7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms