Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms