Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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