Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp29Q9ES63 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp29Q9ES63 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp29Q9ES63 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp29Q9ES63 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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