Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a4bQ9ES61 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ms4a4bQ9ES61 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ms4a4bQ9ES61 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a4bQ9ES61 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a4bQ9ES61 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a4bQ9ES61 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a4bQ9ES61 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms