Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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