Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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