Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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