Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms