Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pop5Q9DB28 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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