Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms