Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms