Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc9bQ9D6E4 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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