Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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