Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lonrf3Q9D4H7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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