Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms