Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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