Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsfl1cQ9CZ44 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms