Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms