Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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