Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms