Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms