Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms