Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms