Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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RTRAFQ9CQE8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RTRAFQ9CQE8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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RTRAFQ9CQE8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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RTRAFQ9CQE8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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RTRAFQ9CQE8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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RTRAFQ9CQE8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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RTRAFQ9CQE8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms