Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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