Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms