Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms