Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms