Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms