Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms