Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Smim11aQ99J19 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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