Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms