Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Slc8b1Q925Q3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc8b1Q925Q3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms