Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cabp4Q8VHC5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms