Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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