Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms