Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8VCE4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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