Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Vmn1r200Q8R281 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Vmn1r200Q8R281 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Vmn1r200Q8R281 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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