Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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